1937年抗日戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)后，土木工程系隨學(xué)校南遷長(zhǎng)沙、昆明，以本系為主成立西南聯(lián)合大學(xué)土木工程系，設(shè)結(jié)構(gòu)、鐵路道路、水利、市政衛(wèi)生四科。1946年土木工程系遷回清華園。

新中國(guó)成立后,1952年全國(guó)高校院系調(diào)整，北京大學(xué)、燕京大學(xué)的土木系并入清華大學(xué)土木系，設(shè)有工業(yè)與民用建筑設(shè)計(jì)、建筑施工、給排水、暖通、建筑材料五個(gè)專業(yè)，學(xué)制5年。同年水利學(xué)科單獨(dú)建立水利水電工程系。1960年與建筑系合并成立土木建筑系。1966年“文化大革命”爆發(fā)，停止招生數(shù)年。到1970年招收第一屆工農(nóng)兵學(xué)員。同年，土木建筑系改稱建筑工程系。

1977年恢復(fù)統(tǒng)一考試，招收“文革”后的第一批本科生，1978年招收“文革”后的第一批研究生。1979年暖通專業(yè)調(diào)入熱能工程系。1980年建筑工程系分成建筑系、土木與環(huán)境工程系，1984年土木與環(huán)境工程系又分為土木工程系、環(huán)境工程系。1986年土木工程系增設(shè)“建筑管理”專業(yè)。 ^[1] 

2000年，為適應(yīng)形勢(shì)的需要，在土木工程系和水利水電工程系的基礎(chǔ)上成立了土木水利學(xué)院，同時(shí)在建筑管理專業(yè)的基礎(chǔ)上組建了建設(shè)管理系。

李慶海 1946-1948

1940-1946年任昆明西南聯(lián)大教授兼土木系主任。

1946-1948年任清華大學(xué)土木系教授、土木系主任并代理工學(xué)院院長(zhǎng)。

1948年在美國(guó)哈佛大學(xué)進(jìn)行訪問(wèn)研究半年，任臺(tái)灣大學(xué)土木系教授。

1949-1950年任廣州嶺南大學(xué)教授。

1950-1952年任北京大學(xué)工學(xué)院土木系教授，兼任衛(wèi)生工程系主任。

1952-1954年任清華大學(xué)土木系教授，給水排水教研室主任。

1954-1956年任清華大學(xué)土木系教授，土木系副主任。

1957-1959年任清華大學(xué)土木系教授兼系主任

1960-1966年任清華大學(xué)土木建筑系教授兼系主任

王國(guó)周 1980-1984

江見(jiàn)鯨 1996.07-1997.11

劉西拉 1997.02-1998.01

1998.01-1998.07

1992.04-1998.02 清華大學(xué)土木工程系，副系主任

1998.01-1998.12 清華大學(xué)土木工程系，系主任

1998.11-2003.06 清華大學(xué)熱電聯(lián)供工程項(xiàng)目建設(shè)辦公室，主任

2001.11-2002.01 清華大學(xué)土木水利學(xué)院，副院長(zhǎng)

2003.06-2011.12 清華大學(xué)土木水利學(xué)院，常務(wù)副院長(zhǎng)

袁 駟

宋二祥

1998.07-2012.01