1942年2月28日，馬國馨出生于山東省濟(jì)南市。

1959年1月～1965年1月，在清華大學(xué)建筑系建筑學(xué)專業(yè)學(xué)習(xí) ^[5]  。

1965年，進(jìn)入北京市建筑設(shè)計(jì)研究院（后改制為北京市建筑設(shè)計(jì)研究院有限公司）工作。同年8月，加入中國共產(chǎn)黨。此后歷任建筑師、副總建筑師、總建筑師、顧問總建筑師。

1978年，參與設(shè)計(jì)毛主席紀(jì)念堂。

1981年1月～1983年1月， 在日本東京“丹下健三城市建筑研究院”研修 ^[5]  。其間參加新加坡國王中心和尼日利亞新國會(huì)大廈設(shè)計(jì)。

1987年1月～1991年1月，在清華大學(xué)建筑學(xué)院，建筑理論及歷史專業(yè)學(xué)習(xí)，獲工學(xué)博士學(xué)位 ^[1]  。

1997年，當(dāng)選中國工程院院士 ^[1]  。

1999年，完成的首都國際機(jī)場第二航站樓設(shè)計(jì)，獲全國第十屆優(yōu)秀工程設(shè)計(jì)建筑金獎(jiǎng)。

2000年8月，設(shè)計(jì)的中國人民抗日戰(zhàn)爭紀(jì)念碑暨雕塑園建成。

2001年，作為北京2008 年申奧場館方案設(shè)計(jì)技術(shù)顧問，他指導(dǎo)了北京申奧場館設(shè)計(jì)方案和設(shè)計(jì)理念，包括奧林匹克公園、奧運(yùn)村、國際廣播中心、北京國際體育中心等 ^[4]  。

2002年，設(shè)計(jì)北京首都國際機(jī)場2號(hào)航站樓。

2003年，主持完成《體育建筑設(shè)計(jì)規(guī)范》編制。

2004年，設(shè)計(jì)秦皇島體育館 ^[6]  。

作為一名建筑設(shè)計(jì)師，馬國馨參與規(guī)劃設(shè)計(jì)眾多大型體育設(shè)施。

20世紀(jì)70年代初，當(dāng)時(shí)還不到30歲的馬國馨就作為項(xiàng)目設(shè)計(jì)主要負(fù)責(zé)人之一承擔(dān)了其建筑設(shè)計(jì)生涯中的第一個(gè)公共建筑項(xiàng)目-北京建外國際俱樂部的設(shè)計(jì)工作，俱樂部有1萬多平方米的面積，包括娛樂、餐廳和網(wǎng)球館、室外游泳、跳水等項(xiàng)目。

馬國馨開始對(duì)于體育場地的規(guī)格標(biāo)準(zhǔn)并不了解。建網(wǎng)球場地時(shí)，從設(shè)計(jì)方案、施工圖到現(xiàn)場施工都在有經(jīng)驗(yàn)的網(wǎng)協(xié)工作人員的幫助下完成的。他認(rèn)為體育建筑設(shè)計(jì)要學(xué)的東西太多。好在北京市建筑設(shè)計(jì)研究院對(duì)體育建筑設(shè)計(jì)有很多經(jīng)驗(yàn)，曾設(shè)計(jì)了北京體育館、懸索結(jié)構(gòu)的北京工人體育館、空間結(jié)構(gòu)的首都體育館等。一批老同志的指導(dǎo)和馬國馨自己的努力為工程的順利進(jìn)行打下了基礎(chǔ)。

國際俱樂部的設(shè)計(jì)施工用了一年的時(shí)間，由此馬國馨與體育結(jié)下了緣分，對(duì)于體育建筑也有了一定的感悟?！皩?duì)于不同體育建筑的設(shè)計(jì)，首先要找準(zhǔn)定位，是用于大型賽事，還是用于商業(yè)運(yùn)營，或是用于開展社區(qū)體育，要根據(jù)用途確定相應(yīng)的規(guī)模檔次。此外，還要符合體育賽事的規(guī)則，在場地、高度、燈光等各方面都要合乎標(biāo)準(zhǔn)，能讓運(yùn)動(dòng)員發(fā)揮出最佳水平，還要考慮安全等因素。 ^[7]  ”

1983年馬國馨完成了在日本的學(xué)習(xí)回到北京，接手第十一屆亞運(yùn)會(huì)場館國家奧林匹克體育中心的規(guī)劃及設(shè)計(jì)。從參加亞運(yùn)會(huì)工程的可行性研究，試做方案到國家奧林匹克體育中心建成，用了7年時(shí)間。他在設(shè)計(jì)中著重兩個(gè)方面：一個(gè)是群體設(shè)計(jì)的總效果，一個(gè)是國奧中心的環(huán)境設(shè)計(jì)。在一些細(xì)節(jié)方面也注意功能的完善，比如在全場實(shí)現(xiàn)了殘疾人無障礙環(huán)境，這在當(dāng)時(shí)全國的體育建筑中也是比較超前的 ^[7]  。

1996年，馬國馨著作獲全國優(yōu)秀科技建筑圖書一等獎(jiǎng)。

從2000年起，馬國馨帶領(lǐng)設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)開始了北京申辦2008年奧運(yùn)會(huì)場館規(guī)劃的設(shè)計(jì)工作。經(jīng)過一年半的規(guī)劃、論證、設(shè)計(jì)和數(shù)十遍地修改，完成申辦奧運(yùn)會(huì)體育場館設(shè)計(jì)方案。2002年，北京奧申委代表團(tuán)向國際奧委會(huì)送交的《申辦報(bào)告》中，包括馬國馨和北京市建筑設(shè)計(jì)研究院眾多建筑設(shè)計(jì)師完成的奧運(yùn)場館及奧林匹克公園的設(shè)計(jì)方案的文件。

憑借在體育建筑設(shè)計(jì)領(lǐng)域的豐富經(jīng)驗(yàn)，加上自己所進(jìn)行的理論歸納和對(duì)中國國外信息的掌握，馬國馨作為主要負(fù)責(zé)人承擔(dān)了國家行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)《體育建筑設(shè)計(jì)規(guī)范》的編制任務(wù)，該規(guī)范已于2003年10月1日開始實(shí)施 ^[7]  。

截至2017年12月馬國馨出版專著譯著19部，發(fā)表學(xué)術(shù)論文401篇 ^[2]  。

馬國馨在設(shè)計(jì)過程中注重對(duì)青年建筑師的指導(dǎo)幫助。待奧運(yùn)申辦成功后，他又將王兵、陳曉民等青年建筑師推上第一線，讓他們向社會(huì)各界介紹申奧場館的設(shè)計(jì)方案，提高他們?cè)谛袠I(yè)及社會(huì)上的認(rèn)知度 ^[9]  。

馬國馨在繁忙的工作中，還兼任清華大學(xué)、北京大學(xué)和北京工業(yè)大學(xué)的客座教授，帶研究生 ^[10]  。

馬國馨主持和負(fù)責(zé)多項(xiàng)國家和北京市的重點(diǎn)工程項(xiàng)目，如毛主席紀(jì)念堂、國家奧林匹克體育中心、首都機(jī)場2號(hào)航站樓、停車樓等，在設(shè)計(jì)成功解決技術(shù)難題和關(guān)鍵性問題，為工程的順利開展和建成做出了重要貢獻(xiàn)。在建筑歷史、建筑理論、建筑規(guī)劃、景觀設(shè)計(jì)、建筑評(píng)論等領(lǐng)域進(jìn)行了有開拓性的工作 ^[1]  。（中國工程院評(píng)）

馬國馨作為一名建筑設(shè)計(jì)師，總是不放過任何了解國外體育設(shè)施的機(jī)會(huì)。多年的實(shí)踐積累和敏銳的觀察思考使他對(duì)于體育建筑有了深刻的感悟。他帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)完成的北京2008年申奧場館規(guī)劃設(shè)計(jì)獲得國際奧委會(huì)委員們的好評(píng) ^[7]  。（人民網(wǎng)評(píng)）

1992 年，在國際奧委會(huì)的領(lǐng)獎(jiǎng)臺(tái)上，馬國馨接過由主席薩馬蘭奇簽字的“體育建筑獎(jiǎng)”國際奧委會(huì)獎(jiǎng)牌，可謂名至實(shí)歸。有專家評(píng)價(jià)他“將整個(gè)國家奧林匹克體育中心當(dāng)作了一個(gè)巨型雕塑來加以考慮，這是國內(nèi)首次大規(guī)模的整體環(huán)境設(shè)計(jì)。 ^[4]  ”（《建筑設(shè)計(jì)管理》評(píng)）