1923年，茅以升、楊銓（杏佛）、涂羽卿、李世瓊等七位教授聯(lián)名致函校評議會和教授會，要求增設(shè)土木工程系和電機工程系。茅以升教授位東南大學工科的奠基人，也是東南大學土木工程系的創(chuàng)始人。

1952年，開始全面學習蘇聯(lián)，按蘇聯(lián)模式建立專業(yè)，成立教研組，制訂各專業(yè)教學計劃及每門課程的教學大綱，當時我系建立了“工業(yè)與民用建筑”、“公路與城市道路”、“工程測量”及“橋梁與隧道”四個專業(yè)。

1953年，橋梁與隧道專業(yè)并入同濟大學。

1952年，南京工學院的胡乾善（倫敦大學博士）和梁治明（麻省理工學院博士）兩位著名教授領(lǐng)銜創(chuàng)立力學教研組。

1953年，正式成立直屬于教務(wù)處的力學教研組，承擔全校（包括無線電、電子工程等系）的理論力學、材料力學課程教學；隨后，南京工學院成立基礎(chǔ)科學系。

1955年，建立“混凝土、鋼筋混凝土制品及預(yù)制構(gòu)件生產(chǎn)專業(yè)”。

1956年，武漢測繪學院成立，土木工程系開始招收了新中國成立以來的第一批研究生。測量專業(yè)大部分教師及主要設(shè)備均并入該院。土木工程系開始招收了新中國成立以來的第一批研究生。

1960年后，“混凝土、鋼筋混凝土制品及預(yù)制構(gòu)件生產(chǎn)專業(yè)”改稱“建筑材料及制品專業(yè)”。成立力學本科專業(yè)。

1964年，開始招收“振動”與“彈塑性力學”研究生。

1981年，中國正式建立起首批碩士、博士授予點。土木工程系結(jié)構(gòu)工程博士點成為東南大學首批7個博士點之一。

1984年，力學教研組和數(shù)學教研組從基礎(chǔ)科學系分出，成立數(shù)學力學系，設(shè)置力學教研室。

1989年底，東南大學將擁有五個專業(yè)的全校最大的土木工程系分設(shè)為土木工程系和交通運輸工程系。土木工程系設(shè)有工業(yè)與民用建筑、建筑材料兩個專業(yè)。

1990年，土木工程系增設(shè)了第三批碩士點：土木、水利工程施工。力學系又增設(shè)了實驗力學碩士點。

1993年，增設(shè)了橋梁與隧道工程、地震工程及防護工程碩士點。

1992年，學校將土木工程系的建筑材料專業(yè)與機械系的金屬材料專業(yè)合并組建成材料科學與工程系，同時，將經(jīng)濟管理學院的建筑管理工程專業(yè)并入土木工程系。

1995年，211工程中的“建筑科學與工程”學科群通過了預(yù)審，土木工程一級學科中的結(jié)構(gòu)工程、地震工程及防護工程二級學科獲得了400余萬元的資助。

1997年10月，原土木工程系的土木學科、數(shù)學力學系的力學學科、交通學院的環(huán)境工程學科重組成立了土木工程學院，由建筑工程系、建設(shè)與房地產(chǎn)系、環(huán)境工程系、工程力學系和實驗中心組成，設(shè)有建筑工程類、環(huán)境工程兩個專業(yè)。隨后增設(shè)了工程管理專業(yè)。

1998年，教育部批準設(shè)立了“土木工程一級學科博士后流動站”；與經(jīng)濟管理學院共同申報的管理科學與工程一級學科博士點獲得批準。

1999年，增設(shè)了工程力學專業(yè)。

2000年，學校成立了“混凝土及預(yù)應(yīng)力混凝土結(jié)構(gòu)教育部重點實驗室”，批準設(shè)立了土木工程一級學科博士點（含6個二級學科博士點：結(jié)構(gòu)工程，防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程，巖土工程，橋梁與隧道工程，市政工程，供熱供燃氣、及空調(diào)工程）。同時還批準設(shè)立了環(huán)境工程二級學科博士點。

2001年，“結(jié)構(gòu)工程”學科列為高等學校國家重點學科，“防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程”學科列為江蘇省級重點學科。

2002年，設(shè)立了給水排水專業(yè)。 ^[3] 

2005年10月，固體力學二級學科獲博士學位授予權(quán)，環(huán)境科學與工程一級學科獲博士學位授予權(quán)。

2004年4月，土木工程建造與管理二級學科博士點申報成功。9月，成立市政工程系。

2006年6月，環(huán)境工程系部分教師轉(zhuǎn)入市政工程系、部分教師轉(zhuǎn)入動力系合并成立能源與環(huán)境工程學院。

2007年08月，國家人事部批準設(shè)立力學博士后流動站。10月，土木工程專業(yè)獲國家一類特色專業(yè)稱號。

2009年10月，工程管理專業(yè)獲準成為國家特色專業(yè)建設(shè)點。

2010年6月，東南大學首個學術(shù)特區(qū)——“城市工程科學技術(shù)研究院”成立。11月，江蘇省高校工程力學分析重點實驗室”獲江蘇省教育廳批準。

2011年12月，呂志濤院士、馮健教授領(lǐng)銜申報“國家預(yù)應(yīng)力工程技術(shù)研究中心”獲科技部批準。 ^{[1]  [6]} 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院有教職工149人，其中教授46名，副教授50名，博士生導(dǎo)師52名，碩士生導(dǎo)師100名。有中國工程院院士1人，國家級教學創(chuàng)新團隊1個，江蘇省教學創(chuàng)新團隊1個，長江學者特聘講座教授1人，國家“千人計劃”人才1人，國家杰出青年基金獲得者1人，教育部跨世紀人才1人，國家級教學名師1人，江蘇省教學名師1人，國家級有突出貢獻的中青年專家2人。 ^[3] 

中國工程院院士：呂志濤 ^[1] 

國家級教學創(chuàng)新團隊：工程結(jié)構(gòu)設(shè)計系列課程教學團隊 ^[3] 

江蘇省教學創(chuàng)新團隊：工程結(jié)構(gòu)設(shè)計系列課程教學團隊 ^[7] 

國家“千人計劃”人才：吳智深 ^[7] 

國家“千人計劃”特聘專家：Noori ^[6] 

國家杰出青年基金獲得者：李愛群 ^[2] 

教育部跨世紀人才：李愛群 ^[6] 

國家級教學名師 ：李愛群 ^[7] 

江蘇省教學名師 ：邱洪興 ^[7] 

國家級有突出貢獻的中青年專家：呂志濤、汪鳳泉 ^[7] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院設(shè)建筑工程、建設(shè)與房地產(chǎn)、工程力學、橋隧與地下工程、市政工程等5個系和1個實驗中心，4個本科專業(yè)。 ^[3] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院有國家級虛擬仿真實驗教學中心1個，國家級實驗教學示范中心1個，教育部首批卓越工程師培養(yǎng)計劃1個，教育部“本科教學工程”專業(yè)綜合改革試點項目1個，江蘇省特色專業(yè)1個，江蘇省品牌專業(yè)1個，江蘇省“十二五”高等學校重點專業(yè)2個，江蘇省級實驗教學示范中心1個，國家級特色專業(yè)建設(shè)點2個、國家精品課程6門、國家精品教材2種、國家級資源共享課程5門。 ^[3] 

國家級虛擬仿真實驗教學中心：國家級土木工程虛擬仿真實驗教學中心 ^[2] 

國家級實驗教學示范中心：土木工程實驗教學示范中心 ^[8] 

國家級一類特色專業(yè)：土木工程 ^[8] 

國家級特色專業(yè)建設(shè)點：工程管理 ^[8] 

教育部首批卓越工程師培養(yǎng)計劃：土木工程 ^[2] 

教育部“本科教學工程”專業(yè)綜合改革試點項目：土木工程 ^[2] 

江蘇省特色專業(yè)：工程管理 ^[8] 

江蘇省品牌專業(yè)：土木工程 ^[8] 

江蘇省“十二五”高等學校重點專業(yè)：土木工程、工程管理 ^[2] 

江蘇省級實驗教學示范中心：江蘇省基礎(chǔ)力學實驗教學示范中心 ^[8] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院有3個一級學科博士后流動站、2個一級學科博士點、12個二級學科博士點、10個二級學科碩士點、2個一級學科碩士點、3個工程碩士點；國家重點學科1個，國家重點學科培育點1個，教育部振興行動計劃重點建設(shè)學科2個，江蘇省重點學科2個，江蘇高校優(yōu)勢學科建設(shè)工程二期項目立項學科1個。 ^[3] 

國家重點學科：結(jié)構(gòu)工程學 ^[3] 

國家重點學科培育點：防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程 ^[3] 

教育部振興行動計劃重點建設(shè)學科：結(jié)構(gòu)工程、防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程 ^[11] 

江蘇省重點學科：防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程、巖土工程 ^[12] 

江蘇高校優(yōu)勢學科建設(shè)工程二期項目立項學科：土木工程 ^[13] 

博士后流動站：土木工程博士后流動站、力學博士后流動站、管理科學與工程（經(jīng)濟管理學院和土木工程學院共建） ^[14] 

一級學科博士點：土木工程、管理科學與工程（經(jīng)濟管理學院和土木工程學院共建） ^[12] 

二級學科博士點：工程力學、巖土工程、市政工程、橋梁與隧道工程（土木工程學院與交通學院共建）、土木工程建造與管理、環(huán)境工程、固體力學、流體力學、結(jié)構(gòu)工程、防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程 ^[12] 

一級學科碩士點：管理科學與工程、力學 ^[15] 

二級學科碩士點：土木工程建造與管理、市政工程、環(huán)境工程、一般力學與力學基礎(chǔ)、建筑技術(shù)科學、巖土工程、結(jié)構(gòu)工程、防災(zāi)減災(zāi)工程及防護工程、橋梁與隧道工程（土木工程學院與交通學院共建） ^[15] 

工程碩士點：工程管理（專業(yè)學位）、工業(yè)工程（專業(yè)學位）、建筑與土木工程（專業(yè)學位） ^[15] 

在國家教育主管部門學位與研究生教育發(fā)展中心2012年全國學科評估高校排名中，東南大學土木工程學科并列全國第3。 ^{[2]  [16]} 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院與名古屋大學合作土木工程前沿學習項目、美國馬里蘭大學工學院簽訂合作協(xié)議、卡耐基梅隆大學土木與環(huán)境系簽署3+1+1學生培養(yǎng)協(xié)議 、英國鄧迪大學共建“3+1+1”合作培養(yǎng)模式，授予國外著名為教授東南大學客座教授，主辦了建筑結(jié)構(gòu)抗震技術(shù)國際論壇、第七屆國際鋼結(jié)構(gòu)進展會議、第二屆國際結(jié)構(gòu)健康監(jiān)測與完整性管理會議、土木工程改革與創(chuàng)新囯際論壇等國際學術(shù)交流會議。 ^[17] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院與歐維姆公司科技合作共建“東大－歐維姆預(yù)應(yīng)力工程技術(shù)聯(lián)合研究中心”，與南京長江都市建筑設(shè)計股份有限公司簽訂產(chǎn)學研合作協(xié)議，與南通四建集團公司簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議 ，與東南大學建筑設(shè)計研究院舉行全面合作協(xié)議，與中鐵大橋局簽署全面科技合作框架協(xié)議 。與江陰海達橡塑公司成立隔震技術(shù)聯(lián)合研發(fā)中心 ，與江蘇黃埔公司聯(lián)合申報成功江蘇省建筑垃圾再生利用工程技術(shù)研究中心，與無錫市交通運輸局簽訂基于物聯(lián)網(wǎng)的公路橋梁智能檢測研究項目合作協(xié)議，與南京銀城地產(chǎn)共建實踐基地。舉辦了古橋研究與保護國際學術(shù)研討會、海峽兩岸土木工程學術(shù)交流會等國內(nèi)學術(shù)交流會議。 ^[17] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院有國家工程技術(shù)研究中心1個，國家地方聯(lián)合工程研究中心1個，教育部重點實驗室2個，教育部工程研究中心1個，江蘇省工程技術(shù)研究中心2個，江蘇省高校重點實驗室1個，江蘇省重點實驗室1個，校級科研機構(gòu)24個。

國家工程技術(shù)研究中心：國家預(yù)應(yīng)力工程技術(shù)研究中心 ^{[3]  [18]} 

國家地方聯(lián)合工程研究中心：玄武巖纖維生產(chǎn)及應(yīng)用技術(shù)國家地方聯(lián)合工程研究中心 ^{[3]  [18]} 

教育部重點實驗室：混凝土與預(yù)應(yīng)力混凝土結(jié)構(gòu)教育部重點實驗室、城建遺產(chǎn)保護教育部重點實驗室 ^{[3]  [18]} 

教育部工程研究中心：低碳型建筑環(huán)境設(shè)備與系統(tǒng)節(jié)能教育部工程研究中心 ^[18] 

江蘇省工程技術(shù)研究中心：江蘇省水處理與生態(tài)修復(fù)工程技術(shù)研究中心、江蘇省建筑垃圾再生利用工程技術(shù)研究中心 ^[18] 

江蘇省高校重點實驗室：工程力學分析江蘇省高校重點實驗室 ^[18] 

江蘇省重點實驗室：江蘇省工程力學分析重點實驗室 ^[1] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院獲國家科技獎10 =項，其中，主持項目獲國家科技進步一等獎1項、國家技術(shù)發(fā)明獎1項、國家科技進步二等獎3項。 ^[2] 

“土、木、工”三字整合設(shè)計組成一個繁體的“東”字，象征東南土木的品牌影響力。 ^[22] 

根據(jù)2016年8月學院官網(wǎng)顯示，學院舉辦了“九龍湖杯”體育比賽、誠信圖書角、暑期社會實踐等活動，組織學生參加了BIM應(yīng)用技能大賽、建設(shè)工程與管理創(chuàng)新競賽、第十一屆華東地區(qū)高校結(jié)構(gòu)設(shè)計邀請賽等競賽。 ^[23] 

自1949年以來，先后任土木系系主任的是梁治明，方左英（1950年5月至8月代系主任）、徐百川、金寶幀（于1956年調(diào)院任副院長），徐百川（文化大革命后一直擔任名譽系主任）、林醒山、張壽庠、陳榮生。分系后土木系主任為蔣永生、副系主任為杜訓(xùn)、孫偉、黃安永；交通運輸工程系主任為陳榮生，副系主任為李峻利、郭永琛、汪中洲。

自1949年以來，先后任土木系總支書記的有陳東、林醒山、程云、劉平、劉訓(xùn)貴、苗培臣、王世澧、胡康宗、沈善土。1989年底分系后，土木系總支正副書記為朱繼澄、黃安永；交通工程系正副書記為沈善土、汪中洲。 ^[24] 

梁治明，1949年任南京大學土木系主任。1946年8月起任中央大學土木系教授，直至1990年病逝。

劉樹勛，曾擔任南京工學院土木系教授、副院長，中國農(nóng)工民主黨第八、九屆中央委員副主席。

丁大鈞，國務(wù)院首批博士生導(dǎo)師。曾獲全國科學大會個人獎我國資深土木工程專家，國際著名混凝土和砌體結(jié)構(gòu)專家，曾參加毛主席紀念堂方案設(shè)計，是中國混凝土構(gòu)件適用性能設(shè)計方法的創(chuàng)始人、東南大學土木工程學科的主要奠基者和開拓者。

孫偉，土木工程系1958年畢業(yè)，中國工程院院士。

蔣永生，土木工程系1961年畢業(yè)。曾任東南大學土木工程學院院長、東南大學教學委員會副主任，全國土木工程專業(yè)學科指導(dǎo)委員會副主任，是東南大學首位獲得國家級教學名師稱號的教師。

呂志濤，土木工程系1961年畢業(yè)，中國工程院院士，其領(lǐng)銜的“現(xiàn)代預(yù)應(yīng)力混凝土結(jié)構(gòu)關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新與應(yīng)用”項目獲得2014年度國家科技進步一等獎。

黃小晶，土木工程系1969年畢業(yè)，曾任福建省省長。

繆昌文，土木工程系1981年畢業(yè)畢業(yè)生，中國工程院院士。

黃衛(wèi)，土木工程系1982屆本科畢業(yè)、1986屆碩士畢業(yè)，現(xiàn)任新疆維吾爾自治區(qū)黨委常委，自治區(qū)常務(wù)副主席，中國工程院院士。

陸紅星，工民建專業(yè)畢業(yè)，任中國化學工程集團公司總經(jīng)理。 ^[25] 

婁宇，土木工程系碩士和博士畢業(yè) ^[26]  ，中國電子工程設(shè)計院總經(jīng)理。 ^[27] 

朱萬福，土木工程系1965年畢業(yè)，曾任東南大學黨委書記。 ^[28] 

游慶仲，土木工程系路橋?qū)I(yè)1983屆本科畢業(yè)，現(xiàn)任江蘇省交通運輸廳廳長。 ^[29] 

戴雅萍，土木工程系畢業(yè)，蘇州設(shè)計研究院股份有限公司董事長 ^[30]  ，全國人大代表。 ^[31]